作为国家旗舰航空公司，克罗地亚航空（OU）的总部邻近萨格勒布，运营枢纽在萨格勒布国际机场（ZAG）。该航空公司指定杜布罗夫尼克机场 (DBV) 和斯普利特机场（SPU）作为重点城市。乘客可以飞往超过 25 个目的地、包括八个克罗地亚境内的目的地。国际目的地包括奥地利、比利时、波斯尼亚和黑塞哥维那、丹麦、法国、德国、希腊、爱尔兰、以色列、意大利、科索沃、马其顿、荷兰、挪威、塞尔维亚、西班牙、瑞士和英国。克罗地亚航空是星空联盟的一部分，已经与十几个航空公司签订了代码共享协议。